PunkBuster разработан так, чтобы обновляться в срок, используя автоматические обновления системы разработчиков. В случаях, когда автоматическое обновление не удается, создали утилиту под названием PBSetup.
Есть два главных компонента к системе PunkBuster: Сервер PunkBuster(запускается на игровых серверах) и PunkBuster клиента (работает на компах игрока, пока они играют). Оба компонента разработаны так, чтобы автоматически обновляться с последними версиями PunkBuster. Программное обеспечение PB Server обычно сверяется с основным PB Servers и загружает новые обновления по Интернету, когда они становятся доступными, и затем распределяет новые версии к PB Clients, когда игроки, со старой версией PunkBuster, подключаются к серверу.